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抗肌萎缩蛋白基因外显子全序列

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  • TA的每日心情
    开心
    2013-1-8 09:11
  • 签到天数: 3 天

    [LV.2]偶尔看看I

    发表于 2012-12-13 19:54:09 | 显示全部楼层 |阅读模式
    6月第二篇抗肌萎缩蛋白基因RNA编码全序列.pdf (143.01 KB, 下载次数: 434)
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  • TA的每日心情
    开心
    2013-1-8 09:11
  • 签到天数: 3 天

    [LV.2]偶尔看看I

     楼主| 发表于 2012-12-13 20:01:40 | 显示全部楼层
    如果你把这个真正看懂就可以自己分析基因检测的报告,希望有兴趣的人认真学习。我很希望我们论坛上有十个以上的家长和患者能够真正看懂。
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  • TA的每日心情
    慵懒
    2016-1-8 19:20
  • 签到天数: 66 天

    [LV.6]常住居民II

    发表于 2012-12-14 16:46:51 | 显示全部楼层
    林宗雄 发表于 2012-12-13 20:01
    如果你把这个真正看懂就可以自己分析基因检测的报告,希望有兴趣的人认真学习。我很希望我们论坛上有十个以 ...

    看不懂。
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  • TA的每日心情
    开心
    2013-1-8 09:11
  • 签到天数: 3 天

    [LV.2]偶尔看看I

     楼主| 发表于 2012-12-14 20:11:20 | 显示全部楼层
    有42个人下载我感到欣喜,许多神内的医生也不一定看得懂的。
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  • TA的每日心情
    奋斗
    2015-3-5 16:51
  • 签到天数: 64 天

    [LV.6]常住居民II

    发表于 2012-12-15 08:17:12 | 显示全部楼层
    林老师辛苦了,但是看不懂呀。
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  • TA的每日心情
    奋斗
    2014-5-11 00:22
  • 签到天数: 181 天

    [LV.7]常住居民III

    发表于 2012-12-15 20:11:27 | 显示全部楼层
    为什么我看到的全是英文啊?
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  • TA的每日心情
    开心
    2013-5-14 08:37
  • 签到天数: 19 天

    [LV.4]偶尔看看III

    发表于 2012-12-16 11:39:57 | 显示全部楼层
    要想看懂,先看看有关遗传基因的基础知识。不用了解过多,就了解下蛋白是如何合成的,可以百度,蛋白的合成能够看懂后,这个图就可以完全看懂。之后,结合答疑群答疑时候,对各种基因检测结果的分析,自己对照图片看老师的分析,琢磨下,就可以看懂,就基本可以解读基础的基因检测结果了,包括点突变的检测结果。
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  • TA的每日心情
    开心
    2013-5-14 08:37
  • 签到天数: 19 天

    [LV.4]偶尔看看III

    发表于 2012-12-16 12:02:01 | 显示全部楼层
    再多啰嗦一点,其实特别想建议家长们学习一下遗传学基础知识,不用了解太多,就学一些基本的,自己的钻研和学习,再加上林老师以及其他老师的指点,相信会在很多问题上迎刃而解,自己明白的多了,对孩子包括对自己的思想也很有帮助,如果仅仅是提问,很多东西不明白,老师的解答有些可能也不能彻底搞懂,最终留一个疑问或者悬念在心里,一碰上其他问题就会将这个悬念勾出,这样老师解答的效果就打了折扣,原本想要达到的目的也没有达到。孩子的病需要的是我们各方面的调整,我们调整好了,就能够有勇气有强大的内心面对一切。这些也是我作为一个家长的心得体会。与大家共勉。
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  • TA的每日心情
    开心
    2013-1-8 09:11
  • 签到天数: 3 天

    [LV.2]偶尔看看I

     楼主| 发表于 2013-5-30 18:26:36 | 显示全部楼层
    回答抗肌萎缩蛋白基因信使RNA全序列上的疑似过早停止码的问题

    正常情况下一个基因的信使RNA序列中只在最后有一个停止码,表明蛋白合成结束。停止码只有三个TAA TAG TGA。点突变中的一种---无义突变,是由于核苷酸(碱基)发生了置换(注意核苷酸的数量没有增减)而形成了以上三个停止码中的一个,造成蛋白合成的过程提早停止,使蛋白失去功能,如原来是CAA,结果由于C变成了T,就形成了TAA的过早停止码。目前正在开展三期临床实验的ataluren(PTC124)就是针对这一类型的基因突变。
    请大家看一下下面的一段抗肌萎缩蛋白基因上信使RNA序列,这是5号外显子的最后一段序列。(第二排与第一排是一样的,只是为了讲解更加直观,将一个一个基因阅读框分开,因为三个核苷酸构成一个氨基酸编码,只有在一个基因阅读框中的TAA TAG TGA才是过早停止码)
             .         .         .         .         .        | 6 .
    GATGGAAATCATAAACTGACTCTTGGTTTGATTTGGAATATAATCCTCCACTGGCAG | GTC

    GAT GGA AAT CAT AAA CTG ACT CTT GGT TTG ATT TGG AAT ATA ATC CTC CAC TGG CAG | GTC

    细心的群友在第一排发现了好几个停止码,有的用粗体,有的用下划线。我们会想这些是不是过早停止码呢?肯定不是。群友江南夜雨把这个叫做疑似过早停止码,这个很贴切。

    解释一下
    我们先来看第四和第五个基因阅读框,CAT AAA。我们发现如果我们把CA去掉就出现了过早停止码TAA,同样我们如果在CA后面加上一个核苷酸,如CAA,也会出现过早停止码TAA。所以有下划线的疑似过早停止码,当在它上游(不一定是与它连接的地方)缺失两个核苷酸或者增加一个核苷酸时,成为真正过早停止码。

    然后我们看第六第七个基因阅读框就可以知道粗体的疑似过早停止码是当它上游(不一定是与它连接的地方)缺失一个核苷酸或者增加二个核苷酸时,成为真正过早停止码。

    讲到这里我们就明白了为什么移码的突变一般是DMD,因为移码突变缺失或者增加的核苷酸不是3的倍数,一定是除3后余1或者2,所以在不远处就会出现过早的停止码使蛋白的合成中止并失去功能。这个不仅对微小缺失和插入的点突变适用,对大片缺失和重复也是一样的。我们举大片缺失的例子,抗肌萎缩蛋白上79个外显子每个的核苷酸数是不一样的,如果是移码缺失总核苷酸数除3是除不尽的,而余数只有两种情况,余1或者余2。余1的就是缺失1个或者增加2个核苷酸后面就会出现停止码,余2的就是缺失2个或者增加1个核苷酸后面就会出现停止码。

    看到停止码,有人会想到是不是可以用PTC124进行治疗。虽然都是出现过早停止码,但是这与无义突变不同。因为无义突变是由于核苷酸的置换形成的,整个基因序列是正常的,只要克服了这一个过早停止码,后面的蛋白合成过程就可以顺利完全。而移码是由于减少或者增加了核苷酸而造成过早停止码,它后面的基因序列还是错误的,克服了前面的过早停止码,后面还会不断产生过早停止码,所以PTC124对此没有治疗作用。
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  • TA的每日心情
    无聊
    2013-11-8 09:23
  • 签到天数: 3 天

    [LV.2]偶尔看看I

    发表于 2013-9-4 10:15:14 | 显示全部楼层
    我看了,但是看不懂,我侄儿的DMD测试,只告诉结果是7外显子信号增高,提示为相就外显子重复。这是DMD吗?症状现在还比较轻,韩大夫说多数为BMD,但却又开激素给他吃。很担心呀。 如果根据全序列,能怎么理解呢
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